La saison 2 devrait s'orienter vers la suite de l'évolution de nos Heroes avec de nouveaux personnages, et de nouvelles d'intrigues palpitantes. Mais l'affaire de l'explosion nucléaire, et celle de Sylar (Zachary Quinto)auront une conclusion cette année même si Sylar sera présent en saison 2, ce qui a été confirmé également.
Pour ce qui est de Peter (Milo Ventimiglia) et Sylar, ils se croiseront lors du season finale.